Сериал "Манифест" начинается с, казалось бы, обычного завершения полета. Самолет Монтего 828 совершает посадку, и люди на борту, облегченные, возвращаются к своей жизни. Однако очень скоро выясняется, что их короткое путешествие обернулось прыжком в будущее. Для всего мира прошло не несколько часов, а целых пять лет.

Пассажиры и экипаж сталкиваются с миром, который давно смирился с их гибелью. Их близкие создали новую жизнь, нашли утешение, а некоторые и вовсе двинулись дальше. Возвращение "погибших" становится не радостным воссоединением, а болезненным потрясением, ломающим сложившийся порядок вещей. Им предстоит заново выстраивать отношения с теми, кто их уже отпустил.

Но самое странное ждет их впереди. У каждого из вернувшихся начинают появляться загадочные видения или голоса, подталкивающие к определенным действиям. Постепенно становится ясно, что их возвращение — не случайность, а часть чего-то большего. Герои пытаются разгадать эту тайну, одновременно борясь за место в жизни, которая, по всем законам, должна была идти уже без них.